Story

Vor einigen Jahren wurden die Pläne von Team Magma und Team Aqua in Hoenn von einem tapferen Pokémontrainer vereitelt. Doch nun treiben sich die beiden Banden in Einall rum. Das Ziel beider Banden ist es die Legendären Pokémon Reshiram und Zekrom für ihre fiesen Pläne zu fangen und auszunutzen. Doch einige Probleme gibt es dabei: Das erste Problem ist, dass es diese Pokémon nur ein einziges Mal auf der ganzen Welt gibt. Das zweite Problem ist, dass sich die beiden Banden gegenseitig im Weg stehen. Und das letzte und größte Problem ist, dass die beiden Pokémon schon zwei jungen Trainern gehören. Tim Kirrin (Trainer Red) von Team Magma wird losgeschickt zu einem der Trainer, die diese Legendären Pokémon besitzen. ??? (ihr könnt in der Planung Bescheid sagen, wenn ihr es sein wollt) von Team Aqua wird ebenfalls zu einem dieser Trainer geschickt. Doch einige junge Trainer haben herausgefunden, was Team Magma und Team Aqua vorhaben und müssen nun versuchen, den Plan der Banden zu duchkreuzen...